Węgiel aktywny cieszy się ogromną popularnością jako skuteczne medium filtracyjne w akwarystyce. Właściwości węgla aktywnego zależą od rodzaju drewna, z którego został wyprodukowany. Filtr z węglem aktywnym ma dwojakie działanie. Po pierwsze, absorbuje substancje organiczne, a po drugie, łączy cząstki organiczne z samym węglem aktywnym. Należy jednak pamiętać, że podczas leczenia ryb zaleca się tymczasowe wyłączenie węgla aktywnego z filtrów akwariowych, aby uniknąć usuwania lekarstw, które mogą być wchłaniane przez ten rodzaj wkładu.