Zanieczyszczenia w zbiornikach wodnych usuwane są naturalnie. Przyczyniają się do tego zarówno zwierzęta, jak i rośliny. W przypadku domowego akwarium jest nieco inaczej. To my jako właściciele akwarium powinniśmy zadbać o oczyszczanie wody. Montując filtr mechaniczny, zapewnimy właściwy ruch wody, przeprowadzając jednocześnie procesy oczyszczania. Wnętrze filtra zawiera gąbkę (filtr mechaniczny) lub inne materiały filtracyjne (filtr chemiczny), które umożliwiają rozwój bakterii korzystnych dla jakości wody. Współczesne filtry akwarystyczne wyposażone są w mechanizm, który generuje ruch powierzchni wody, co jednocześnie dostarcza tlen do wody. To oznacza, że nie trzeba już inwestować w oddzielne urządzenie do napowietrzania wody, oszczędzając w ten sposób na dodatkowych kosztach.